โรงเรียนเตรียมอุดมศึกษาพัฒนาการ ยานนาเวศ เดิมชื่อ โรงเรียนยานนาวา โดย กระทรวงศึกษาธิการ ได้ซื้อที่ดิน จำนวนเนื้อที่ จำนวน 8 ไร่ 1 งาน 89 ตารางงวา จาก นางแจ่ม เพชรรัตน์ และนายราชัน ไวว่อง เป็นจำนวนเงิน 982,810.00 บาท เมื่อวันที่ 25 มีนาคม 2501 และ วันที่ 15 เมษายน 2501 ได้ประกาศจัดตั้งโรงเรียนมัธยมวิสามัญศึกษา ประเภทสหศึกษา สังกัดกองโรงเรียนรัฐบาล กรมวิสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการ ขื่อ “ โรงเรียนยานนาวา ” ตำบลทุ่งวัดดอน อำเภอยานนาวา จังหวัดพระนคร ใช้อักษรย่อว่า “ ย.น.” สร้างอาคารเรียน 1 หลัง จำนวน 12 ห้องเรียน (เปิดห้องเรียน 10 ห้อง และ ห้องหัตถศึกษา 2 ห้อง) เรียกว่า อาคาร 1 , บ้านพักครู 1 หลัง มี 2 ห้อง, บ้านพักภารโรง 1 หลัง, สุขาภิบาล 1 หลัง เปิดทำการเรียนการสอน วันที่ 10 กรกฎาคม 2501 ( จึงถือว่า วันที่ 10 กรกฎาคม เป็นวันสถาปนาโรงเรียน ) โดยรับนักเรียนชายและหญิง ที่จบชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 เข้าศึกษาในระดับชั้น มัธยมศึกษาปีที่ 1 (ม.1)
วันที่ 30 เมษายน 2501 นายจรัส ธรรมพันธ์ ได้รับการแต่งตั้งจาก กรมวิสามัญ กระทรวงศึกษาธิการ ให้ ดำรงตำแหน่ง ครูใหญ่ คนแรก มีครู 7 คน นักเรียน 416 คน นักการ 2 คน
วันที่ 12 เมษายน 2514 ฯพณฯ สุกิจ นิมมานเหมินทร์ รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ได้เปลี่ยนชื่อ “ โรงเรียนยานนาวา” เป็น “โรงเรียนยานนาเวศวิทยาคม” เพื่อหลีกเลี่ยงความสับสนชื่อโรงเรียนที่ไปเหมือนกับโรงเรียนเทศบาลวัดยานนาวา และในปีการศึกษานี้ โรงเรียนได้ขยายชั้น ม.3 เป็น 10 ห้องเรียน ชั้น ม.1 และ ม.2 ชั้นละ 10 ห้องเรียน ชั้น ม.4 แผนกวิทยาศาสตร์ 4 ห้อง แผนกศิลปะ 4 ห้อง รวม 38 ห้องเรียน มีครู 70 คน นักเรียน 1,647 คน นักการ 9 คน ระดับชั้น มัธยมศึกษาปีที่ 1 ถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 6
วันที่ 10 มิถุนายน 2563 นายสุชาติ กลัดสุข ผู้อำนวยการสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 2 ลงนามในประกาศ สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 2 ประกาศ ให้โรงเรียนยานนาเวศวิทยาคม เปลี่ยนชื่อ เป็น “ โรงเรียนเตรียมอุดมศึกษาพัฒนาการ ยานนาเวศ “ตามมติที่ประชุมของคณะกรรมการศึกษาธิการจังหวัดกรุงเทพมหานคร เพื่อเป็นการสร้างเครือข่ายทางวิชาการที่เข้มแข็ง มีการพัฒนาศักยภาพนักเรียน พัฒนาศักยภาพครู เกิดการแลกเปลี่ยนเรียนรู้ในด้านการบริหารและการจัดการศึกษาที่ดี โดยนายรื่น หมื่นโกตะ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน